BrainyCP

Не знаю что да как, переустановил, развернул в точности также и все работает....

Если возникают проблемы, то первым делом надо сделать две вещи.
проверить нет ли подключенных репозитариев которые не совместимы с панелью, типа epel
подключенные внешние репозитаоии к системе находятся тут
/etc/yum.repos.d/

если есть, то нудно удалить все его установленные пакеты включая и сам пакет release, после чего обновить все
yum clean all

постотреть состояние сервисов
systemctl status nginx -l
systemctl status httpd -l

логи так же могут помочь прояснить ситуацию