В правах я не вижу проблем
команду ls -al вы показали уже после выполнения команды mknod -m 666 /dev/null c 1 3 ?
хостаккаунт в jail?
Вывод команды из под рут или пользователя (через sudo)?-bash: /dev/null: Permission denied
Панель не потребляет много памяти и процессора.Куда её brainy сжирает вообще, на что?