BrainyCP

сделать с консоли под рутом
yum clean all

и потом переустановить certbot с панели

rm -rf /etc/brainy/tpl/basic/tpl_c/*

исправлено

Модуль подключили?

Примерно так
[root@vpskvmbury nginx]# cat nginx.conf
user nginx;
worker_processes 2;
load_module "/usr/lib64/nginx/modules/ngx_pagespeed.so";
pcre_jit on;

error_log /var/log/nginx/error.log;
...

потом
systemctl restart nginx

покажите вывод
yum list installed | grep pagespeed

mariadb 10.4 пока отозван, у него оказалась несовместимость части служебных таблиц со всеми предыдущими версиями проделайте ниже приведенные операции, чтобы востановить работу панели на 10.3 cp /etc/brainy/tmp/dump_old.sql /etc/brainy/tmp/dump_old.sql2 rpm -qa | grep maria yum remove -y mariadb10.4 ...

можете показать что у вас переписалось в конфиге nginx?

сделайте бекапы. проблема с базами была обнаружена только у 10.4
обязательно еще надо сделать бекап базы smtp

не надо ставить mariadb 10.4, более того она уже отозвана

если бы это была единственная причина мы бы так и сделали. В действительности причин большое количество.

установите последнее обновление. При ошибке, посмотрите лог /var/log/brainy/cert.log. В нем содержится команда , которая получает панель на выполнение. Попробуйте ее выполнить в командной строке. Ошибка может быть связана с записью имен в DNS. Если будете испытывать проблемы, свяжитесь с нами в чате...